电子邮件通常基于明文协议传输，没有加密和验证服务，攻击者可在邮件传输的任意节点截获数据或篡改内容，造成电子邮件数据泄露或身份仿冒。PGP加密和S/MIME加密都被用于电子邮件加密和验证，但二者在多个方面存在差异。

PGP（全称：Pretty Good Privacy，优良保密协议），是一套用于信息加密、验证的应用程序，可用于加密电子邮件内容。PGP本身是商业应用程序；同类开源工具名为GnuPG（GPG）。PGP及其同类产品均遵守OpenPGP数据加解密标准。

S/MIME是Secure/Multipurpose Internet Mail Extensions (安全多用途互联网邮件扩展协议)的缩写，是采用PKI技术的用数字证书给邮件主体签名和加密的国际标准协议。1992年，MIME（多用途互联网邮件扩展）协议编撰完成，用于互联网邮件服务器和网关之间通信。该标准方法支持非ASCII编码的附件格式，意味着你可以发送附件并保证文件可以送达另一端，但是附件有时会被篡改，无法确保邮件机密性和完整性。1995年，S/MIME(安全/多用途互联网邮件扩展)协议V1版本开发问世，对安全方面的功能进行了扩展，提供数字签名和邮件加密功能，邮件加密用来保护电子邮件的内容，数字签名用于验证发件人身份，防止身份冒用，并保护电子邮件完整性。1998年和1999年相继出台V2/V3版本并提交IETF形成系列RFC国际标准。

公钥可信度：S/MIME标准中，用户必须从受信任的证书颁发机构申请X.509v3数字证书，由权威CA机构验证用户真实身份并签署公钥，确保用户公钥可信，收件人通过证书公钥验证发件人身份真实性。而PGP不提供强制创建信任的策略，由发件人自己创建并签署自己的密钥对，或为其他通信用户签署公钥增加其密钥可信度，没有任何受信任的权威中心去验证核实身份信息，每个用户必须自己决定是否信任对方。

加密保护的范围：PGP的诞生是为了解决纯文本消息的安全问题，而S/MIME不仅保护文本消息，更旨在保护各种附件/数据文件。

集中化管理：从管理角度来看，S / MIME被认为优于PGP，因为它具有强大的功能，支持通过X.509证书服务器进行集中式密钥管理。

兼容性和易用性：S/MIME具备更广泛的行业支持，S/MIME协议已经内置于大多数电子邮件客户端软件中，如Outlook、雷鸟和iMail等都支持S/MIME加密。从最终用户的角度来看，S/MIME的易用性也优于PGP，因为PGP需要下载额外的插件才能运行，S / MIME协议允许大多数供应商发送和接收加密电子邮件而无需使用其他插件。